01
材料计算概述
什么是材料计算 · 应用领域 · VASP / MS / LAMMPS / QE 简介
入门全景
02
Linux基础 (上)
为什么需要Linux · 虚拟机安装 · Ubuntu安装与基本配置
环境虚拟机
03
Linux基础 (下)
常用命令 · 权限管理 · vim · 环境变量
命令配置
04
编译器与数学库安装
GCC/Intel oneAPI · OpenMPI · BLAS/LAPACK
编译并行
05
VASP安装 (上)
VASP简介 · 依赖库(FFTW/LAPACK) · Makefile配置
VASP依赖
06
VASP安装 (下)
编译串行/并行 · 常见错误 · 测试运行
编译调试
07
VASP输入文件详解
INCAR · POSCAR · POTCAR · KPOINTS
输入参数
08
VASP任务提交与监控
PBS/Slurm基础 · 作业脚本 · 状态查看
调度集群
09
Materials Studio安装 (上)
MS简介 · 双平台安装 · License服务器
MSLicense
10
Materials Studio安装 (下)
Gateway配置 · 客户端连接 · 问题排查
服务网络
11
Materials Studio基础操作
界面 · 分子建模 · 晶体/表面构建
建模可视化
12
MS计算任务设置
CASTEP · DMol3 · Forcite 参数设置
计算模块
13
LAMMPS安装
源码编译 · CMake选项 · 标准/自定义包 · 测试
LAMMPS编译
14
LAMMPS输入文件 (上)
in文件结构 · units/atom_style · region/create_box · 力场
脚本分子
15
LAMMPS输入文件 (下)
pair_style/coeff · fix/compute · dump · run
命令输出
16
LAMMPS势函数文件
EAM/LJ/Buckingham · 获取/转换 · 自定义势
势函数力场
17
Quantum ESPRESSO安装
QE简介 · HDF5/NetCDF/ScaLAPACK · 并行编译
QEDFT
18
QE输入文件
pw.x结构 · &CONTROL/SYSTEM · &ELECTRONS · K_POINTS
输入参数
19
QE赝势文件
模守恒/超软/PAW · 下载转换 · 测试验证
赝势精度
20
Gaussian安装
Gaussian简介 · Linux/Windows · 环境变量 · 并行
Gaussian量化
21
Gaussian输入文件
gjf格式 · Route Section · 基组 · 任务类型
输入基组
22
Gaussian输出文件解读
输出结构 · 能量/梯度 · 频率 · IRC/过渡态
分析后处理
23
CP2K安装
CP2K简介 · libint/libxc/libxsmm · Regtest验证
CP2K编译
24
CP2K输入文件
GLOBAL/FORCE_EVAL/MOTION · &SUBSYS/CELL · &DFT/SCF
输入MD
25
Python在材料计算中的应用
Anaconda · ASE · pymatgen 安装与使用
Python自动化
26
ASE基础操作
原子结构 · 优化/分子动力学 · VASP/LAMMPS接口
ASE工作流
27
pymatgen基础操作
晶体操作 · 相图 · 能带/态密度 · VASP文件处理
pymatgen分析
28
作业调度系统深入
Slurm配置 · PBS/Torque · 作业数组 · 资源优化
调度HPC
29
高性能计算集群使用
集群登录 · scp/rsync · module环境 · GPU加速
集群GPU
30
综合实战:从头搭建材料计算环境
需求分析 · 软件选型 · 配置测试 · 性能优化与排障
实战全栈